57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  69.31 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  44.33 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  32.83 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  31.76 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  32.98 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.32 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  31.32 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.32 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.32 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  30.05 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.6 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.32 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.54 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  34.12 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.55 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.55 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.55 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  32.73 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  32.18 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  29.7 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  30.11 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  29.29 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  29.41 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.95 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  29.47 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.47 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  26.16 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  26.16 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  26.14 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  28.04 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  26.14 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  26.16 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  26.14 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  28.5 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  29.94 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  30.77 
 
 		 306 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26.29 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  30.67 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  28.25 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  28.25 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  29.69 
 
 		 176 aa  44.7  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  25.99 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  27.72 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  32.38 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  29.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  29.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  29.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  30.77 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  29.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4917  protein LpfE  26.98 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  27.72 
 
 		 345 aa  42  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  26.34 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  26.34 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  26.34 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  26.2 
 
 		 210 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  28.66 
 
 		 304 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>