47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69760 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  40.36 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  37.66 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  36.74 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  36.21 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  37.32 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6640  fimbrial protein  35.06 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447531  hitchhiker  0.00000000139123 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  30.64 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  31.97 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  31.97 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  27.27 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  27.27 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  28.19 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  26.85 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  33.11 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  28.78 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  27.42 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  31.48 
 
 		 187 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.77 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  23.95 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  32.76 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1270  putative fimbrial protein  30.84 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.20213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  26.67 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  28.81 
 
 		 180 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  28.81 
 
 		 180 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  28.81 
 
 		 180 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  25.64 
 
 		 172 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  27.95 
 
 		 194 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  27.95 
 
 		 194 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  25 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  25 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  25 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  25 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  25.97 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  25.97 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  25.97 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  25.97 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.97 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  27.95 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.95 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  27.95 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  27.95 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  26.45 
 
 		 176 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  26.45 
 
 		 176 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  26.45 
 
 		 176 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  29.17 
 
 		 327 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  31.14 
 
 		 183 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>