41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1678 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  99.74 
 
 		 387 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  100 
 
 		 387 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  40.85 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  34.93 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  36.03 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  34.93 
 
 		 209 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  33.57 
 
 		 222 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  33.57 
 
 		 222 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  30.88 
 
 		 319 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  31.62 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  27.94 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  27.27 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6640  fimbrial protein  28.67 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447531  hitchhiker  0.00000000139123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  27.97 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  27.78 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  32.47 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  31.69 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3925  hypothetical protein  34.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  27.75 
 
 		 329 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  29.73 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  29.93 
 
 		 331 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  27.91 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  26.49 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  27.88 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  26.92 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  32 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  28.28 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  32.24 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  26.37 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  32.24 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  24.44 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  32.24 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  32.24 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  26.12 
 
 		 176 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  30.67 
 
 		 172 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  26.12 
 
 		 176 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>