60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1816 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  100 
 
 		 338 aa  686    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  32.72 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  33.33 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  34.42 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  32.37 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  29.41 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  28.45 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  26.46 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  33.12 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  29.15 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  28.64 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  28.14 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  28.14 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  25.3 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  25.81 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  27.94 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  25.93 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  27.27 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  25.28 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  32.43 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  25.08 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  28.02 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  32.47 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  32.47 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  30.38 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  29.25 
 
 		 190 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  29.25 
 
 		 190 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  29.25 
 
 		 187 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  27.04 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  26.29 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  29.3 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  29.3 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  29.3 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  29.3 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  29.3 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.3 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  28.66 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  28.66 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  23.95 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.27 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  26.36 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.82 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.82 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.82 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  28.57 
 
 		 184 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  28.57 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4842  putative major fimbrial protein  26.86 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  23.49 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  26.29 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  27.23 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  27.27 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5004  putative major fimbrial subunit  26.5 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  27.7 
 
 		 181 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  27.03 
 
 		 187 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4949  putative major fimbrial subunit  26.15 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  35.42 
 
 		 175 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  27.5 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  26.67 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5001  putative major fimbrial subunit  25.8 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4915  putative major fimbrial subunit  25.8 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>