59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6926 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  100 
 
 		 340 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  33.22 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  30.59 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  30.46 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  43.29 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  34.71 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  32.82 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  46.02 
 
 		 134 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  30.19 
 
 		 311 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  34.33 
 
 		 228 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  36.99 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  36.99 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  36.99 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  25.41 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  28.5 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  26.46 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  24.51 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  31.03 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4404  adhesin 20K  44.33 
 
 		 99 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  28.31 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  27.84 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  22.76 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  26.13 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  26.86 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  30 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  30 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  30 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  28.89 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  28.57 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  25.3 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  23.26 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  24.37 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  29.58 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3723  fimbrial protein  25.75 
 
 		 364 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  29.75 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  23.31 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  30.94 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  30.07 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  31.94 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4917  protein FimH  30.94 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  28.21 
 
 		 177 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  23.91 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3677  FimH mannose-binding domain protein  30.94 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.376605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5826  protein FimH  30.94 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4847  protein FimH  30.94 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4546  protein FimH  30.94 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04189  minor component of type 1 fimbriae  30.94 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  23.3 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3743  FimH mannose-binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0870674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  29.3 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  27.33 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  23.51 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04151  hypothetical protein  30.22 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  31.75 
 
 		 175 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  30.34 
 
 		 176 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  30.34 
 
 		 176 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  31.41 
 
 		 181 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.25 
 
 		 187 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  27.08 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>