21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3677 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3677  FimH mannose-binding domain protein  100 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.376605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04189  minor component of type 1 fimbriae  99.67 
 
 		 300 aa  594  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5826  protein FimH  99.67 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  99.67 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4847  protein FimH  99.67 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691376 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3743  FimH mannose-binding domain-containing protein  99.33 
 
 		 300 aa  594  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0870674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4546  protein FimH  99.67 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04151  hypothetical protein  99.33 
 
 		 300 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4917  protein FimH  98.67 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  48.15 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  47.81 
 
 		 304 aa  265  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  47.81 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  47.81 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  47.81 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  47.81 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  47.81 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  47.47 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1764  protein FimH  57.63 
 
 		 59 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0083  fimbrial protein  27.27 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  30.94 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3389  fimbrial protein  23.17 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>