24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3389 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3389  fimbrial protein  100 
 
 		 317 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  26.25 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  25.94 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.94 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  25.94 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  25.94 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  25.94 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  26.63 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  25.31 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  30 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3743  FimH mannose-binding domain-containing protein  24.13 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0870674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5826  protein FimH  23.17 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4546  protein FimH  23.17 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4917  protein FimH  23.17 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4847  protein FimH  23.17 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3677  FimH mannose-binding domain protein  23.17 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.376605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04189  minor component of type 1 fimbriae  22.86 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  28.68 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  22.86 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04151  hypothetical protein  24.05 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  23.78 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  25.35 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  27.87 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>