45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2545 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  100 
 
 		 360 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  35.63 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  34.71 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  33.21 
 
 		 338 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  34.5 
 
 		 334 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  33.46 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  32.03 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  44.78 
 
 		 134 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  30.68 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  31.38 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  38.56 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  36.99 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  38.1 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  38.1 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4404  adhesin 20K  44.44 
 
 		 99 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  27.74 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  28.87 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  28.57 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.12 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  30.12 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.95 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  28.57 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.12 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 172 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 180 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 180 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  29.11 
 
 		 180 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 180 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  30.94 
 
 		 181 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  27.5 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  26.36 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  27.24 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  30.46 
 
 		 179 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  23.6 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  33.12 
 
 		 179 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  26.45 
 
 		 184 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  32 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  27.04 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  25.52 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  31.45 
 
 		 177 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  32 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  29.24 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  33.12 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  28.49 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.58 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>