57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2969 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  100 
 
 		 338 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  30.46 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  33.21 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  42.36 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  30.46 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  43.65 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  40.74 
 
 		 134 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  43.2 
 
 		 228 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  36.05 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  31.27 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  33.78 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  33.78 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  33.78 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  28.41 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  27.7 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  27.2 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4404  adhesin 20K  45.36 
 
 		 99 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  26.67 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  29.58 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  25.08 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  28.41 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  29.79 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  33.77 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  27.56 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.79 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.79 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  30 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  34.01 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  31.13 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  34.01 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  27.48 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  34.01 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  27.98 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  34.31 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  30.61 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  29.66 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  28.89 
 
 		 222 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  28.89 
 
 		 222 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  34.65 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  32 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4958  fimbrial protein  28.2 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524555  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  28.15 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  28.15 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  28.36 
 
 		 187 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  31.87 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  26.16 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.13 
 
 		 190 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  33.33 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  24.82 
 
 		 187 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  25.44 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  31.9 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  31.97 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.13 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.13 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  27.81 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  28.03 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  26.8 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>