114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1052 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  100 
 
 		 345 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  43.7 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  34.22 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  34.52 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  38.17 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  38.17 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  38.17 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  38.17 
 
 		 204 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  24.51 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  40.13 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  38.36 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  28.24 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  30.19 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  29.55 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4842  putative major fimbrial protein  32.72 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  38.22 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  33.77 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  33.77 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  28.64 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5004  putative major fimbrial subunit  32.1 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  31.08 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4949  putative major fimbrial subunit  32.1 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5001  putative major fimbrial subunit  32.1 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4915  putative major fimbrial subunit  32.1 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  30.61 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.03 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  30.46 
 
 		 177 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  33.11 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  33.11 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  30.07 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  30.82 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  30.5 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  30.07 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  32.48 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.45 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1888  fimbrial protein  29.06 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0436738  hitchhiker  0.00532877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.8 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  30.38 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  29.65 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  29.25 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  28.85 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  30 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  28.38 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  31.45 
 
 		 176 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  31.45 
 
 		 176 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  31.45 
 
 		 176 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  32.24 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  32.24 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  32.89 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  32.24 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  32.24 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  34.23 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  30.14 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  31.48 
 
 		 183 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.82 
 
 		 176 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  30.82 
 
 		 176 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  30.82 
 
 		 176 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  30.82 
 
 		 176 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  30.82 
 
 		 176 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  28.64 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  30 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  33.57 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.33 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.33 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.33 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  28.21 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  27.01 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  26.34 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  24.13 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4156  hypothetical protein  30.77 
 
 		 355 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  32.24 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  32.24 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  32.24 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  33.33 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  32.24 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  25.88 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  25.88 
 
 		 190 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  25.88 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  33.33 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.19 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.19 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.19 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4958  fimbrial protein  33.33 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524555  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  31.58 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  31.58 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  32.89 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  32.03 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  30.94 
 
 		 180 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.48 
 
 		 174 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30.92 
 
 		 176 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  31.18 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  27.39 
 
 		 181 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  31.21 
 
 		 209 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  29.35 
 
 		 181 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.45 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  27.72 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  28.35 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26.32 
 
 		 200 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  32.45 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  32.45 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>