81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0836 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  87.98 
 
 		 209 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  52.04 
 
 		 222 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  52.04 
 
 		 222 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  39.07 
 
 		 351 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0764  fimbrial protein  90.91 
 
 		 129 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  31.65 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3925  hypothetical protein  43.54 
 
 		 148 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  35.57 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  34.93 
 
 		 387 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  34.93 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  34.23 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  26.77 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3926  hypothetical protein  45.12 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  28.28 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  32.17 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  26.71 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6640  fimbrial protein  31.3 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447531  hitchhiker  0.00000000139123 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  27.7 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  28.19 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  27.57 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.92 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  30.82 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  27.71 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  25.91 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  29.01 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.53 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  26.96 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  29.53 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.66 
 
 		 187 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  28.65 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  28.86 
 
 		 185 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  30.14 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  29.53 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  35.59 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  34.15 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  28.86 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  30.77 
 
 		 193 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  30.61 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  34.85 
 
 		 175 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  24.92 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  23.6 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  30.91 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  32.48 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  26.13 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  27.08 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  26.71 
 
 		 183 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  28.23 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  31.16 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  28.23 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  28.19 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  26.95 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  28.23 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  28.23 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  28.23 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.13 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  30.83 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  28.69 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  30.83 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  29.13 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  29.13 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  29.13 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  29.13 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  30.95 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  29.13 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  29.13 
 
 		 176 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  28.69 
 
 		 179 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  29.13 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  29.1 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  30.07 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  27.16 
 
 		 171 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  27.16 
 
 		 171 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.16 
 
 		 171 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  27.16 
 
 		 171 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  27.16 
 
 		 171 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  30.97 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  29.09 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  29.09 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  29.09 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  27.85 
 
 		 200 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  26.5 
 
 		 172 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>