106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6274 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  100 
 
 		 306 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  31.36 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  34.2 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  34.02 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  34.02 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  33.51 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  28.5 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  28.36 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  28.23 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  33.83 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  27.24 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  28.89 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  37.04 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  28.67 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  32.45 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  25.93 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  28.38 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  28.62 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  25.54 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  29.58 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  29.73 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  24.69 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  28.75 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  34.67 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  28.63 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  28.95 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  29.25 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  27.71 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.1 
 
 		 176 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  28.87 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  34.23 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  26.62 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  28.7 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  27.65 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  25.2 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.69 
 
 		 175 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  26.51 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.12 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.12 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.12 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  29.8 
 
 		 193 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  32.64 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  32.64 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  22.64 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  29.93 
 
 		 185 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  32.56 
 
 		 187 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  25.9 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.77 
 
 		 174 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.77 
 
 		 174 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.93 
 
 		 185 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.77 
 
 		 174 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  29.7 
 
 		 194 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  29.09 
 
 		 194 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.09 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.28 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  29.09 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  29.09 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  29.09 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  29.09 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  24.13 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  25.3 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  32.19 
 
 		 177 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  29.71 
 
 		 183 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  29.25 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  31.72 
 
 		 174 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  29.93 
 
 		 185 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  32.43 
 
 		 179 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1888  fimbrial protein  31.61 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0436738  hitchhiker  0.00532877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  27.78 
 
 		 174 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  27.2 
 
 		 134 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  29.93 
 
 		 185 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.8 
 
 		 187 aa  45.8  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  30.77 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  26.42 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  31.52 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.42 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  30.56 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  30.56 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  30.56 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  30.56 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  30.56 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.42 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  31.76 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  23.67 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  33.1 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  28 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.82 
 
 		 174 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  28.87 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  31.88 
 
 		 228 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  29.81 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.27 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  27.27 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  27.27 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  27.27 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  27.27 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  27.27 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  27.27 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  29.58 
 
 		 170 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  29.58 
 
 		 170 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  38.1 
 
 		 150 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>