94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1498 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  100 
 
 
359 aa  737    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  42.09 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  42.03 
 
 
371 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1888  fimbrial protein  43.44 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0436738  hitchhiker  0.00532877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  35.26 
 
 
362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  35.07 
 
 
360 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  32.64 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.03 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  25.1 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  26.67 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.45 
 
 
175 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  28.65 
 
 
209 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  26.94 
 
 
300 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  37.39 
 
 
203 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  34.67 
 
 
306 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  29.63 
 
 
185 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.63 
 
 
185 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  33.87 
 
 
222 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  33.87 
 
 
222 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  27.5 
 
 
187 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  32.58 
 
 
193 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  32.58 
 
 
193 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  29.01 
 
 
185 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  27.37 
 
 
176 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  26.67 
 
 
305 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  27.37 
 
 
176 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  27.37 
 
 
176 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  28.65 
 
 
298 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  26.54 
 
 
175 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  29.63 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  29.03 
 
 
194 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  29.01 
 
 
185 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  29.03 
 
 
194 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  29.03 
 
 
194 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  29.03 
 
 
194 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.03 
 
 
194 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  29.03 
 
 
194 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  29.41 
 
 
178 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  28.97 
 
 
178 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  30.5 
 
 
334 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  31.78 
 
 
193 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  26.46 
 
 
396 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.18 
 
 
176 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  28.18 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.18 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.18 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.18 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  28.18 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.18 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.18 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  30.53 
 
 
195 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  28.28 
 
 
178 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  28.83 
 
 
190 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.83 
 
 
190 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  30.83 
 
 
196 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  29.02 
 
 
228 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3290  fimbrial protein  34.51 
 
 
197 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0324288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  28.48 
 
 
180 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  28.48 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  28.48 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  28.28 
 
 
178 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  28.48 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  28.48 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  28.48 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.48 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  28.48 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  29.3 
 
 
180 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  24.44 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  27.67 
 
 
177 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  27.96 
 
 
194 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  31.34 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  24.44 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  26.04 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6640  fimbrial protein  25.58 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447531  hitchhiker  0.00000000139123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  23.93 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  27.5 
 
 
172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  29.41 
 
 
181 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  27.5 
 
 
172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  27.5 
 
 
172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  27.5 
 
 
172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  27.33 
 
 
179 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  25.45 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  23.68 
 
 
319 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  32.43 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  27.33 
 
 
179 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  28.14 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  26.42 
 
 
172 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1019  fimbrial protein CupB6  27.66 
 
 
379 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  26.71 
 
 
192 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  24.26 
 
 
168 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  24.26 
 
 
171 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  24.26 
 
 
168 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  24.26 
 
 
171 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  24.26 
 
 
171 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>