69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0124 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  100 
 
 		 334 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  35.43 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  36.36 
 
 		 396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  34.38 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  42.44 
 
 		 228 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  33.22 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  33.6 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  33.2 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  34.5 
 
 		 360 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  41.35 
 
 		 134 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  43.65 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  31.89 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  28.45 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  29.59 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4404  adhesin 20K  49 
 
 		 99 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  35.53 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  35.53 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  34.87 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  37.5 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  26.44 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  30.48 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  29.39 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  26.44 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  25.09 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  25.4 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  25.54 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  26.48 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  24.3 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  28.68 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  26.88 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  28.85 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  35.71 
 
 		 185 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  28.76 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  35.71 
 
 		 185 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  26.54 
 
 		 179 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  27.02 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  31.55 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  26.21 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  31.55 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  31.55 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  31.55 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  26.54 
 
 		 179 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.55 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  31.55 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  31.55 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  27.01 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  31.55 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  35.12 
 
 		 185 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  29.01 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  24.92 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  27.91 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  30.11 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  24.76 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  28.86 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  27.91 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  26.22 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  35.71 
 
 		 185 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  35.71 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.57 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  30 
 
 		 187 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  28.12 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  28.12 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  28.12 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  27.61 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  28.12 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  25.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  30.56 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>