251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2878 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  100 
 
 		 175 aa  350  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  64.43 
 
 		 174 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  41.14 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  43.48 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  43.95 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  36.78 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.52 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.87 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.87 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  35.16 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  35.16 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  32.12 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  35.88 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  35.88 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  35.88 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  32.12 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  32.12 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  32.12 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  32.12 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  38.22 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  34.86 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.96 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  32.22 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.46 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  34.13 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.46 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.46 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  30.21 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  36.18 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  36.18 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  32.26 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  33.89 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  33.97 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.13 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  33.13 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  32.26 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  30.73 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  33.13 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.74 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  33.97 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  29.28 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  33.97 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  33.97 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  36.84 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  33.97 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  33.97 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  33.97 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  34.62 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  30.17 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  31.61 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  33.94 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  38.22 
 
 		 345 aa  63.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  32.96 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.91 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.91 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.91 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  32.45 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  31.28 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  32.4 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.13 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  33.13 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  33.13 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  33.13 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  33.13 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.73 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.81 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  30.85 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.81 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  36.54 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  33.13 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  32.34 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  35.67 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.32 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  28.32 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  29.51 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  28.32 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  30.54 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  28.32 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  30.54 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  30.54 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  28.32 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  31.79 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  34.46 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.9 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.9 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  34.23 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  34.23 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>