254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0022 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  100 
 
 		 172 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  40.56 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  40.56 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  40.56 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  40.56 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  40.56 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  41.44 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  41.44 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  40.56 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  43.95 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  43.95 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  46.2 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  47.1 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  45.36 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  48.39 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  48.39 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  48.39 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  38.59 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  38.59 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  38.59 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  36.84 
 
 		 185 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  35.79 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  39.87 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  35.79 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  39.87 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  38.71 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  38.12 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  38.12 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  38.12 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  38.12 
 
 		 210 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  34.44 
 
 		 174 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  35.26 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  34.44 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  34.44 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  34.44 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  34.74 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  37.33 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  36.76 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  34.44 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  36.81 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  36.81 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  36.81 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  36.42 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  41.61 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  40.99 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  40.99 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  40.99 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  40.99 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  40.99 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  40.99 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  40.99 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  35.33 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  32.03 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  37.09 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.88 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.88 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.88 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.88 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  33.88 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  30 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  40.16 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  36.72 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.93 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  30.51 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  30.27 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  28.49 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.38 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.33 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.33 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  34.05 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.38 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  36.25 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  33.69 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  29.61 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  29.61 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  29.61 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  29.61 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  29.61 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  35.62 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  31.32 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  34.59 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  34.81 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  28.99 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  32.04 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.79 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  32 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  30.43 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  32.24 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  32.24 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  30.43 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  29.53 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  25.52 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  30.67 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.79 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.79 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.79 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>