208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3079 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  99.42 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  99.42 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  99.42 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  99.42 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  57.31 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  57.31 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  57.31 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  56.73 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  57.31 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  47.4 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0635  fimbrial protein  100 
 
 		 65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.903445  normal  0.214993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0579  fimbrial protein  96.92 
 
 		 65 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  36.84 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  33.94 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  33.15 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  32.97 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  36 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  33.15 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  33.15 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  34.46 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  33.11 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.43 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.43 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.43 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  32.45 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  32.45 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  32.45 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.81 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  32.89 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  32.89 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  32.67 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  28.65 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  28.65 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  28.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  28.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  28.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  28.35 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  28.29 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  28.29 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.66 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  32.96 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  32.96 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  32.96 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  32.96 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  27.66 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  32.96 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  27.66 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.48 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  35.44 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  27.66 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  27.96 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  32 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  29.07 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  32 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.11 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  32 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  32.96 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  32 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  33.11 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  33.11 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  32 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  32.02 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  33.13 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  32 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  32 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  32 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  32.4 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.68 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.68 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.68 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.68 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  30.86 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  30.86 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.7 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  26.7 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  26.7 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  26.7 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  27.27 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  26.7 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.18 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  26.7 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  29.38 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  27.27 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  27.22 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  28.38 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  27.6 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  28.38 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  28.38 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  28.38 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  24.05 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  27.96 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  23.49 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  23.49 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  28.38 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  23.49 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  23.49 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  32.45 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  26.67 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>