17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0579 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0579  fimbrial protein  100 
 
 		 65 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  96.92 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  96.92 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  96.92 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  96.92 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  96.92 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0635  fimbrial protein  96.92 
 
 		 65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.903445  normal  0.214993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  61.54 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  61.54 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  61.54 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  61.54 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  61.54 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  55.56 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  36.92 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  37.5 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  40.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  40.3 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>