181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0594 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  100 
 
 
172 aa  350  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  100 
 
 
172 aa  350  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  100 
 
 
172 aa  350  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  100 
 
 
172 aa  350  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  98.26 
 
 
172 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  57.31 
 
 
171 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  57.31 
 
 
171 aa  191  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  57.31 
 
 
171 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  57.31 
 
 
171 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  57.31 
 
 
171 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  57.8 
 
 
174 aa  191  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  36.84 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  37.34 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0579  fimbrial protein  61.54 
 
 
65 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0635  fimbrial protein  60 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.903445  normal  0.214993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  33.33 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  33.33 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  33.33 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  33.33 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  32.12 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  32.12 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  32.12 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  32.75 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  34.67 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  34 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  33.12 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  36.24 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  34.67 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  36.24 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  32.42 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  34.67 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  35.33 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  34.67 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  32.21 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  32.21 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  32.42 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  32.42 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  30.81 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  34.67 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  34.67 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  30.67 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  30.67 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  30.67 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  30.67 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  30.67 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  34.16 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  35.33 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.32 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.32 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.32 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.32 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25.32 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  28.31 
 
 
210 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  27.49 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  27.49 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  27.49 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  34 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  34 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  34 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.92 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  25.68 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  24.68 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  32.08 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  25.97 
 
 
181 aa  57.4  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  26.44 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.93 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  26.44 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.44 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  31.93 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  34.38 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  26.44 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  26.44 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  31.33 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  32.34 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  32.89 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  32.89 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  31.33 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  31.33 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  33.53 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  31.33 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  33.53 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  29.89 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  32.89 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  32.89 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  32.89 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  32 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  32.89 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  30.67 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  31.1 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  27.27 
 
 
193 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  35.29 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30.49 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.49 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  29.49 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  29.49 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  29.49 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  29.49 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  28.19 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  29.49 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  29.49 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>