297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4840 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  100 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  91.85 
 
 		 184 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  91.21 
 
 		 182 aa  296  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  92.86 
 
 		 182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  92.86 
 
 		 182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  92.86 
 
 		 182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  63.64 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  63.64 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  53.76 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  52.69 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  52.69 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  52.69 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  56.96 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  50 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  66.39 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  53.49 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  50.96 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  50.96 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  50.96 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  50.96 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  50.96 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  50.96 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  50.96 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  50.32 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  45.36 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  45.36 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  45.36 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  46.41 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  47.06 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  47.06 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  41.53 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  41.53 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  41.53 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  41.53 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  46.2 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  46.2 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  46.2 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  46.2 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  48.15 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  42.08 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  33.88 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  33.88 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  33.88 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  33.88 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  35.44 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  34.81 
 
 		 165 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  34.81 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  35.8 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  43.9 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  35.93 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  34.66 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  34.66 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  34.66 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  35.39 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  32.12 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  36.51 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  36.36 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  36.51 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  36.51 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  36.13 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.52 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  33.52 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  33.52 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  33.52 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  33.52 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  37.37 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  34.83 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  34.83 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  34.83 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  34.95 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  33.33 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  33.33 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  33.33 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  33.33 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  30.85 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  34.81 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  34.01 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  32.78 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  33.96 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.71 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  36.67 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  33.14 
 
 		 336 aa  71.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  34.07 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  36.13 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  36.67 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  36.67 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  36.67 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  36.67 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.1 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  32.9 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  29.79 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  30.89 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  31.87 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  34.94 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  32.9 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  33.86 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  30.89 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  34.94 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  31.87 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  30.89 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>