153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2230 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  100 
 
 		 323 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  99.69 
 
 		 323 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  97.1 
 
 		 323 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  99.02 
 
 		 204 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  35.4 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  36.11 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  37.31 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  36.84 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  30.12 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  34.02 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  38.17 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  33.16 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  35.46 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  36.99 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  31.91 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  36.99 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  32.47 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  31.25 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  33.57 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  31.76 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  36.3 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  38.31 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  31.63 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  30.99 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  35.22 
 
 		 182 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  36.99 
 
 		 185 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  36.3 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  36.55 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  28.14 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  27.7 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  30.59 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  38.13 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  38.13 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  38.13 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  30.63 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  33.09 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  35.48 
 
 		 193 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  32 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  31.03 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  33.15 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  28.82 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  33.15 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  32.9 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  30 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  32.08 
 
 		 172 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  33.95 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.67 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.82 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.82 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.82 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.82 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  32.61 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  34.59 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  34.59 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  30.63 
 
 		 190 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  34.59 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  32.28 
 
 		 170 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  32.28 
 
 		 170 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  33.95 
 
 		 182 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  32.28 
 
 		 170 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26 
 
 		 165 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  29.94 
 
 		 190 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.94 
 
 		 190 aa  52.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  31.37 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  30.12 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  30.63 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.33 
 
 		 165 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  30.63 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  31.65 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  31.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  31.65 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  31.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  31.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.67 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  31.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  31.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  31.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  31.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  30.63 
 
 		 177 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  31.29 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  31.25 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  31.25 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  31.25 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.61 
 
 		 171 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  31.61 
 
 		 187 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  30.28 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  31.61 
 
 		 171 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  31.61 
 
 		 171 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  31.61 
 
 		 171 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  28.22 
 
 		 183 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  31.61 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  31.61 
 
 		 171 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  31.76 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  31.61 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  27.14 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>