112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4139 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  54.09 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  52.35 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  36.24 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  31.07 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  33.15 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  33.77 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  34.97 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  33.95 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  25.97 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  29.94 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  34.15 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  34.15 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  34.15 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  34.15 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  30.07 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  29.38 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  30.72 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  30.72 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.87 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  28.97 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  33.54 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.43 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  30.43 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  29.81 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  27.37 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  27.37 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  27.37 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  27.37 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  27.37 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  29.07 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  34.75 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  28.95 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  29.05 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  28.48 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  29.53 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  28.4 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  29.34 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  35.29 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  31.13 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  26.95 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  31.13 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  31.13 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  31.13 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  30.32 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  30.32 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  30.14 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  35.29 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  35.29 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  35.29 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  35.29 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.46 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  30.46 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  26.97 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  26.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  26.82 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.35 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  32.35 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  32.35 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  32.35 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  32.35 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  24.34 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  24.34 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  25 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  24.34 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  27.1 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  27.1 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  27.1 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  27.1 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  27.22 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  27.1 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  25 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  27.5 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  25 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.85 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  27.85 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  27.85 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  27.85 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  27.85 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2177  fimbrial protein  30.06 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  27.85 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  27.85 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  29.3 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  25.95 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  25 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  25 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  27.47 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.5 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.5 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.5 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.5 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.5 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  23.74 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  27.5 
 
 		 188 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  25.93 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  25 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>