166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4672 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  34.21 
 
 		 187 aa  97.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  37.57 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  37.02 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  37.02 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  37.02 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  37.02 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  36.07 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  34.97 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4724  fimbrial protein  30.94 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0545532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  31.76 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  32.77 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  32.77 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  32.77 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  32.77 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  33.87 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  33.87 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  33.53 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  33.87 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  32.92 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.77 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.77 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.77 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  31.25 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4147  fimbrial protein  33.15 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.41 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.41 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  29.57 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.41 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.05 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  30.73 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  28.74 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.29 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  32.29 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  31.77 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  29.81 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  33.12 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  33.12 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.18 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  31.18 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  31.18 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  31.18 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  31.18 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  30.27 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  31.02 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  31.18 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  32.02 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  30.27 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.46 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  31.18 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  31.77 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  31.46 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  28.88 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  28.02 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  30.27 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  31.21 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  31.48 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.43 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  25.52 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  25.52 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  25.52 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  26.58 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  30.43 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  30.39 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  25.52 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.49 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  29.03 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  33.33 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  28.07 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  30 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  29.03 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  29.03 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  27.22 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  28.48 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  30.56 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  30.56 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  30 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  26.97 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  31.07 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  30.86 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  30.86 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  29.76 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  28.96 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  28.96 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  29.61 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  28.96 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  28.96 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  30.53 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  28.89 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  28.98 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  28.89 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  28.89 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.32 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  26.32 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  26.32 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  26.32 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  26.32 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  26.32 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  26.32 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  25.93 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>