58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4724 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4724  fimbrial protein  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0545532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4147  fimbrial protein  59.76 
 
 		 180 aa  217  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  35.57 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  30.94 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  28.57 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  28.04 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  28.04 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  28.04 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  28.04 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  27.51 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  28.75 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  28.19 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  30 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  27.54 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  28.49 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  26.51 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  28.57 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  26.51 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  26.71 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  26.09 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  26.09 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.09 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  26.09 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  26.09 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  24.06 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  27.33 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  27.33 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  31.62 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  27.33 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  27.39 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  27.39 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  26.75 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  26.75 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  24.85 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  25.31 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  25.79 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  23.86 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  23.81 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.81 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  23.81 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  23.81 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  24.86 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  25.77 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  25.77 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  23.3 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  24.86 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  24.84 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  20.77 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  24.84 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  24.84 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  24.84 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  26.35 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  26.35 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  26.35 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.64 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  26.75 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  23.98 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>