157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0590 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  99.39 
 
 		 164 aa  337  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  99.39 
 
 		 164 aa  337  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  58.68 
 
 		 181 aa  213  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  34.59 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  35.22 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  35.22 
 
 		 185 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  34.59 
 
 		 185 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  35.22 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  34.59 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  35.1 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  35.1 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  35.1 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  35.1 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  35.1 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  35.1 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  35.1 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  30.92 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.14 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.14 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.14 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  31.55 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  29.11 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.11 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  29.11 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  29.11 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  29.11 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  29.11 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  29.11 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  29.11 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  24.67 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.53 
 
 		 190 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  27.53 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.53 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  30.38 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  31.41 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  25.81 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  25.81 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  29.94 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  29.94 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  29.94 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  29.94 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  29.94 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  28.85 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  27.22 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  24.02 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  29.3 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  29.3 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  27.63 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  27.63 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.63 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  27.63 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  27.63 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  27.63 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  27.63 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  27.63 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  26.71 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.38 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  29.22 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.29 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.29 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.29 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  26.71 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  26.71 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  26.71 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  26.71 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  30.43 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  27.39 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.56 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  27.39 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2177  fimbrial protein  25.17 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  27.39 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.56 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.52 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  24.52 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  24.52 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  24.52 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  24.52 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  25 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  24.52 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  24.52 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  24.5 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  30.48 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  25.47 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  22.64 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  22.64 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  22.64 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  24.68 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  22.64 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  31.37 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  22.64 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  24.84 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  26.42 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.67 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  26.97 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  26.97 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  26.8 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  28.67 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  26.97 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>