104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0216 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  99.46 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  99.46 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  42.93 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3171  putative fimbrial subunit  45.5 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.320855  normal  0.326781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3152  putative fimbrial subunit  45.5 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3088  putative fimbrial subunit  45.5 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3269  putative fimbrial subunit  45.5 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0251275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  37.17 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  38.74 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  38.22 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02263  predicted fimbrial-like adhesin protein  37.7 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1318  Fimbrial protein  37.7 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02224  hypothetical protein  37.7 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1314  fimbrial protein  37.7 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  39.56 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  39.56 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  39.56 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  39.56 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  36.96 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  39.56 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  36.27 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  32.8 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  33.12 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  35.29 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  32.28 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  33.51 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  27.4 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  26.2 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.28 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.28 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.28 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  26.63 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  29 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  34.31 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  33.94 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  25.13 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  34.15 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  25.13 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  25.13 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  37.93 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  37.93 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.73 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  32.23 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  37.93 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  26.63 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  28.96 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.63 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  26.63 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  26.63 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  30.11 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  26.63 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  26.63 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  33.61 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  32.39 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.74 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  27.27 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  30.43 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  30.43 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  30.43 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  30.43 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  30.43 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  32 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  28.08 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  32 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  32 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  23.76 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  24.18 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  28.49 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  28.49 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  28.49 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  26.67 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  30.53 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  30.53 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  29.57 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  29.61 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  29.61 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  29.61 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  24.73 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  30.53 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  27.94 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.99 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4144  fimbrial protein  22.22 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  24.14 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  26.99 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  35.29 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  26.06 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  23.81 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  27.94 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  29.03 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  29.03 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  29.03 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.29 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  35.29 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  35.29 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  35.29 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  27.46 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  27.46 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  29.63 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>