100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0062 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  100 
 
 		 348 aa  712    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  59.6 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  60.17 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  42.44 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  32.37 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  37.31 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  36.82 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  37.81 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  36.82 
 
 		 204 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  28.04 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  27.2 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  28.01 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  28.44 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  32.45 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  28.91 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  28.68 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  29.89 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  29.89 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  29.89 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  28.63 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  31.14 
 
 		 193 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  27.56 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  32.28 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  32.28 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  32.28 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  32.28 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  27.14 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  26.59 
 
 		 329 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.65 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  32.07 
 
 		 170 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  27.6 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30690  hypothetical protein  26.19 
 
 		 351 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000866279  hitchhiker  0.000842933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.98 
 
 		 190 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  29.01 
 
 		 182 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.95 
 
 		 165 aa  49.3  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  27.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  25 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  33.33 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  26.35 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  26.35 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.66 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  26.35 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  26.35 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  28.66 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.12 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.14 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  28.66 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  28.4 
 
 		 174 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  30.98 
 
 		 170 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  30.98 
 
 		 170 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  25.71 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  30.98 
 
 		 170 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  31.18 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26.67 
 
 		 165 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6686  fimbrial protein  27.32 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  30.19 
 
 		 173 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  30.25 
 
 		 176 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  30.25 
 
 		 176 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  30.25 
 
 		 176 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  30.25 
 
 		 176 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.71 
 
 		 176 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.75 
 
 		 165 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.05 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.05 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.05 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  21.82 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.05 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  27.11 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  31.11 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.05 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  31.11 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  23.01 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  29.63 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  29.63 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  29.63 
 
 		 176 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  29.01 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  21.82 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  21.82 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.33 
 
 		 171 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  21.82 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  21.82 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  31.33 
 
 		 171 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  21.82 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  27.5 
 
 		 187 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  27.5 
 
 		 187 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  29.01 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  28.44 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  27.71 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  27.71 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  30.72 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  27.71 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  30.72 
 
 		 171 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  30.72 
 
 		 171 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  30.72 
 
 		 170 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  25.26 
 
 		 177 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  30.72 
 
 		 171 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  29.81 
 
 		 185 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  30.72 
 
 		 170 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  29.75 
 
 		 172 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>