121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0050 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  92.37 
 
 
354 aa  659    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  100 
 
 
354 aa  715    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  59.6 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  46.48 
 
 
345 aa  275  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  33.33 
 
 
338 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  40.65 
 
 
323 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  37.81 
 
 
323 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  40.65 
 
 
323 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  36.89 
 
 
204 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  26.99 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  27.2 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  30.48 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  29.66 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  29.08 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  29.08 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  29.96 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1618  hypothetical protein  26.1 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0147  hypothetical protein  26.1 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0169  hypothetical protein  26.1 
 
 
342 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.82 
 
 
182 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  28.57 
 
 
336 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  29.41 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0133  fimbrial protein subfamily protein  27.34 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  25.87 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  31.9 
 
 
193 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  34.78 
 
 
380 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  27.74 
 
 
360 aa  56.6  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  26.61 
 
 
317 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  25.88 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.45 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.92 
 
 
190 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.45 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.45 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  31.45 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  28.92 
 
 
190 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.92 
 
 
190 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.94 
 
 
165 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.94 
 
 
179 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.94 
 
 
179 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.94 
 
 
179 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.94 
 
 
179 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  33.57 
 
 
345 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.94 
 
 
165 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  30.82 
 
 
172 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  30.77 
 
 
176 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  30.77 
 
 
176 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.25 
 
 
175 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  30.77 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.3 
 
 
165 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  28.37 
 
 
371 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  27.88 
 
 
362 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.43 
 
 
210 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  41.11 
 
 
171 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.13 
 
 
176 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  30.13 
 
 
176 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  29.33 
 
 
177 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  30.13 
 
 
176 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  30.13 
 
 
176 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  30.13 
 
 
176 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  41.11 
 
 
171 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  28.19 
 
 
187 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  28.19 
 
 
190 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  28.19 
 
 
190 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  30.87 
 
 
176 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  40 
 
 
187 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  30.87 
 
 
176 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  26.85 
 
 
181 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  30.87 
 
 
176 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  40 
 
 
171 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  30.87 
 
 
176 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  34.21 
 
 
174 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  40 
 
 
171 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6686  fimbrial protein  24.51 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850094  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  29.56 
 
 
182 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  29.56 
 
 
182 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.25 
 
 
176 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  31.06 
 
 
170 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  31.06 
 
 
170 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  31.06 
 
 
170 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  30 
 
 
184 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  40 
 
 
171 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.57 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  29.56 
 
 
182 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  40 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  40 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  30.2 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  40 
 
 
171 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  29.07 
 
 
200 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  23.31 
 
 
194 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  30.07 
 
 
183 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  30.2 
 
 
176 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  23.31 
 
 
194 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  28.95 
 
 
370 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  29.53 
 
 
176 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  25.41 
 
 
336 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0139531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.31 
 
 
194 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  23.31 
 
 
194 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  23.31 
 
 
194 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  23.31 
 
 
194 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  26.37 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>