53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2234 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  100 
 
 		 338 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  28.87 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  35.71 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  30.43 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  26.55 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  30.86 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  29.41 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  26.88 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  30.91 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  34.69 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  31.54 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  31.54 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  29.58 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  29.58 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  26.76 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  34.68 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.28 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  24.36 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  30 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  29.59 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  25.09 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  32.06 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  25.1 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  25.19 
 
 		 134 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  25.35 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  27.74 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  27.52 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  27.52 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  27.52 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  30.08 
 
 		 181 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  25.1 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  26.24 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  22.67 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  26.06 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  25.17 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  27.82 
 
 		 190 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  27.82 
 
 		 190 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  27.82 
 
 		 187 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6640  fimbrial protein  27.46 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447531  hitchhiker  0.00000000139123 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  26.27 
 
 		 181 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  29.1 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  43.24 
 
 		 187 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  27.82 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  24.41 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  27.15 
 
 		 169 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5001  putative major fimbrial subunit  25.08 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4842  putative major fimbrial protein  25.08 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4915  putative major fimbrial subunit  25.08 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  25.2 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  27.15 
 
 		 181 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  27.15 
 
 		 181 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4949  putative major fimbrial subunit  25.08 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5004  putative major fimbrial subunit  25.08 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>