118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6670 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  75.16 
 
 		 187 aa  257  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  63.82 
 
 		 190 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  63.82 
 
 		 190 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  63.82 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  61.18 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  34.46 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  34.46 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  34.46 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  35.91 
 
 		 180 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  38 
 
 		 207 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  34.23 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  33.33 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  37.34 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  36.41 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  37.04 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  38.35 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  34.93 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  31.37 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  30.26 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  35.54 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  33.33 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  32.4 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  34.36 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  32.4 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  32.4 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  33.11 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  32.4 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  32.4 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  31.74 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  33.77 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  32.78 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  33.33 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  33.99 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  33.99 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  33.99 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.77 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  33.77 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  33.77 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  33.33 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  33.33 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  33.33 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  31.49 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  32.78 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.78 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  30 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  30 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  30 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  33.69 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  37.23 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  29.94 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  29.94 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  29.94 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  28.19 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  28.19 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  39.1 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  29.79 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  30.1 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  28.31 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  31.01 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  31.01 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  31.01 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  36.27 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  33.95 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.48 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  28.47 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  27.39 
 
 		 345 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.54 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  37.5 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  28.25 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  28.25 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  28.67 
 
 		 323 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  31.62 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  29.57 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  29.57 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  31.52 
 
 		 306 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  31.71 
 
 		 327 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.63 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  28.22 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  28.48 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  26.85 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  36.84 
 
 		 339 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  27.52 
 
 		 338 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  28.73 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  27.63 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  30.38 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  28.31 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  28.66 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  28.73 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  27.63 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  31.78 
 
 		 336 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  25.56 
 
 		 354 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  27.63 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  28.57 
 
 		 323 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  26.67 
 
 		 313 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  31.41 
 
 		 340 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  30.28 
 
 		 336 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.15 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  25.67 
 
 		 190 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.15 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>