109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3031 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  75.16 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  66.45 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  66.45 
 
 		 190 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  66.45 
 
 		 190 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  62.5 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  36.78 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  38 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  36.6 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  36.6 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  36.6 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  34.07 
 
 		 182 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  34.81 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  34.83 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  44.04 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  33.11 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  41.96 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  33.91 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  33.53 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  33.92 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  33.92 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  33.92 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  34.25 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  33.92 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  33.92 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  35.71 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  33.71 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.33 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  35.06 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  35.06 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  35.03 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  32.94 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  32.94 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  32.94 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  31.67 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  29.53 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  29.53 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  31.52 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  35.67 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.57 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  28.57 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  28.57 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  32 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  32 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  40.46 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  28.57 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  32 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  32.03 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  32.03 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  32.03 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  30.67 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  28.75 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  37.93 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  30.99 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  32.26 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  31.21 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  31.21 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  31.21 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  37.25 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  30.63 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  29.71 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  29.71 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  29.71 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  30.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  30.92 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  30.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  30.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  30.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  27.15 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  28.48 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  28.48 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  27.15 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  25 
 
 		 338 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  30.52 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  27.27 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  30.52 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  31.29 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  25.71 
 
 		 313 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  30.4 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  27.01 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  28.49 
 
 		 360 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.54 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  29.56 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  26.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  26.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  34.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  26.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  27.71 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.17 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  26.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26.67 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  27.03 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  25.91 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  28.85 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  27.97 
 
 		 327 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  26 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  27.95 
 
 		 174 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  33.88 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>