157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0126 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  100 
 
 		 169 aa  344  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  99.41 
 
 		 181 aa  343  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  98.82 
 
 		 181 aa  342  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  60.95 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  61.54 
 
 		 207 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  56.77 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  39.49 
 
 		 181 aa  97.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  39.49 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  39.49 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  38.27 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  39.1 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  34.46 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  38.22 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  36.42 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  34.87 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  35.9 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  40.62 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  45.05 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  36.31 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  34.88 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  34.88 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  34.88 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  33.11 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.77 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  31.79 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  31.79 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  31.79 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  35.14 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.57 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  32.54 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  31.68 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  30.57 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  30.57 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  26.47 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  43.14 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  26.47 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  26.47 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.76 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.76 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.76 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  29.94 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  29.94 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  29.94 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  31.11 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  31.68 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  29.38 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  28.75 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  31.45 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.03 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  32.16 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  38.28 
 
 		 209 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  34.12 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.63 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.49 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.58 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.58 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  39.19 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  31.58 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  31.58 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  33.33 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  33.33 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  32 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  32 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  34.4 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  32 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  32 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  34.4 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  34.4 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  35.1 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  25.83 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  28.14 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  31.45 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  33.62 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  36.78 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  36.23 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  36.23 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  36.23 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  32.08 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  32.08 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  36.23 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  41.94 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  31.82 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  28.31 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  28.31 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.61 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  29.41 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  27.11 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  27.11 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  29.41 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  29.41 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  27.11 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  26.61 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  26.61 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  26.61 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  26.61 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  31.76 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  31.76 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  34.26 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  31.76 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  27.88 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>