96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0129 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  87.78 
 
 
181 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  66.01 
 
 
187 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  63.82 
 
 
181 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  36.93 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  36.93 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  35.2 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  41.18 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  36.13 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  35.76 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  36.24 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  35.53 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  35.16 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  31.21 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  30.56 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  30.64 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  36.59 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  37.06 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  35.56 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  31.35 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  31.35 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  31.35 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  31.35 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  31.35 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  31.58 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  33.91 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  34.68 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  34.68 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  34.68 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  35.06 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  35.06 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  36.36 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.13 
 
 
182 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  34.84 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  31.58 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  31.58 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  43.4 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  43.52 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  29.25 
 
 
338 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  31.06 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  30.05 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  30.61 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  30.05 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  30.05 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  30.61 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.61 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  30.61 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  30.6 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  31.43 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  31.13 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  31.13 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  31.13 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  29.93 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  30.05 
 
 
185 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  35.54 
 
 
331 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  29.55 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  32 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  28.67 
 
 
354 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.6 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  28.19 
 
 
354 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30.6 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  28.36 
 
 
338 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  29.61 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  29.61 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  30.56 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  31.13 
 
 
339 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  28.65 
 
 
345 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  30.6 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.95 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.95 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.95 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.95 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.95 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  31.11 
 
 
313 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.47 
 
 
323 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  31.2 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.95 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  37.5 
 
 
182 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.47 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  29.38 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.47 
 
 
323 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  36 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  30.47 
 
 
323 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  29.45 
 
 
305 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  28.95 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  27.71 
 
 
348 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.78 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.78 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.78 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  50 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  29.61 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  29.61 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  33.07 
 
 
327 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  29.45 
 
 
340 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>