88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2163 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  100 
 
 		 176 aa  349  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  100 
 
 		 176 aa  349  8.999999999999999e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  100 
 
 		 176 aa  349  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  55.31 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  47.49 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  46.33 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  46.33 
 
 		 178 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  45.45 
 
 		 178 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  45.45 
 
 		 178 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  45.45 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  46.89 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  46.89 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  46.89 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  36.9 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  41.21 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  40.76 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  45.28 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  38.24 
 
 		 186 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  40.46 
 
 		 182 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  43.18 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  35.52 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  34.76 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  33.33 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  34.71 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  34.71 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  34.71 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  33.73 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  32.05 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  32.05 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  35.54 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  31.21 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  33.51 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  34.4 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  25.97 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  32.28 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.57 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  29.95 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  31.35 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  28.72 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  36.07 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  31.18 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.68 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  25.7 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  33.12 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  25.7 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  31.65 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  27.51 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  32.82 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  33.09 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  32.82 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  32.82 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  32.82 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  35.53 
 
 		 209 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  31.01 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  30.77 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  35.03 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  30.25 
 
 		 183 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  30.68 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  29.17 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  29.17 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  46.3 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  46.3 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  46.3 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  34.03 
 
 		 334 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  30.25 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  27.12 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  27.57 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  27.57 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  28.97 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  26.7 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  26.37 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  27.17 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  26.63 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  26.37 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  26.37 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  29.73 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  27.11 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  28.22 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  28.49 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  28.49 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  36.45 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  28.49 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  28.65 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  24.73 
 
 		 200 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  25.27 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.37 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>