51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0293 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  55.62 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  40.32 
 
 		 202 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  42.08 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  42.08 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  42.08 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  36.9 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  36.9 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  36.9 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  40 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  38.5 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  42.5 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  37.84 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  37.3 
 
 		 178 aa  91.3  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  37.3 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  36.76 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  36.76 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  36.76 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  31.48 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  35.71 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  34.24 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  32.09 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  31.55 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  31.55 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  33.85 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  31.21 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  31.35 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  31.58 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  39.08 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  33.08 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  34.26 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  30.48 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  30.85 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  33.88 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  33.88 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  33.88 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  27.75 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  28.93 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  28.73 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  27.62 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  27.47 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  27.62 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  37.5 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  30.53 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  28.74 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  30.53 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  30.53 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  28.34 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  30.53 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  36 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  28.96 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>