16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A5004 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4949  putative major fimbrial subunit  99.72 
 
 		 361 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5001  putative major fimbrial subunit  99.17 
 
 		 361 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4842  putative major fimbrial protein  98.61 
 
 		 361 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4915  putative major fimbrial subunit  99.17 
 
 		 361 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5004  putative major fimbrial subunit  100 
 
 		 361 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  28.1 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  32.1 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  25.58 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  29.94 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  28.84 
 
 		 317 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  25.75 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  27 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  26.5 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  28.4 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  28.74 
 
 		 193 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.89 
 
 		 165 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>