22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4917 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4917  protein FimH  100 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5826  protein FimH  99 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3677  FimH mannose-binding domain protein  98.67 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.376605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4847  protein FimH  99 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691376 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3743  FimH mannose-binding domain-containing protein  98.67 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0870674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4546  protein FimH  99 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04189  minor component of type 1 fimbriae  98.33 
 
 		 300 aa  587  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  98.33 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04151  hypothetical protein  98 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  47.81 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  47.47 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  47.47 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  47.47 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  47.47 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  47.47 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  47.47 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  46.53 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1764  protein FimH  55.93 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0083  fimbrial protein  27.27 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  30.94 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3389  fimbrial protein  23.17 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  26.42 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>