18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1764 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1764  protein FimH  100 
 
 		 59 aa  114  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  96.61 
 
 		 304 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817928 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  94.92 
 
 		 304 aa  110  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  94.92 
 
 		 304 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  93.22 
 
 		 304 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  93.22 
 
 		 304 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  93.22 
 
 		 304 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  93.22 
 
 		 304 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  93.22 
 
 		 304 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3743  FimH mannose-binding domain-containing protein  57.63 
 
 		 300 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0870674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04151  hypothetical protein  57.63 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5826  protein FimH  57.63 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  57.63 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4847  protein FimH  57.63 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4546  protein FimH  57.63 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3677  FimH mannose-binding domain protein  57.63 
 
 		 300 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.376605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04189  minor component of type 1 fimbriae  57.63 
 
 		 300 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4917  protein FimH  55.93 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>