22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0083 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0083  fimbrial protein  100 
 
 
321 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  27.33 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.33 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  27.33 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  27.33 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  27.33 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  27.33 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  26.74 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.173626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  23.92 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  26.16 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817928 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  24.15 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  28.28 
 
 
300 aa  49.7  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  21.12 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4917  protein FimH  27.27 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04189  minor component of type 1 fimbriae  27.27 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5826  protein FimH  27.27 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4847  protein FimH  27.27 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.691376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4546  protein FimH  27.27 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3677  FimH mannose-binding domain protein  27.27 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.376605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3743  FimH mannose-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
300 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0870674  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04151  hypothetical protein  27.27 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  23.44 
 
 
340 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>