49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3723 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3723  fimbrial protein  100 
 
 		 364 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  55.75 
 
 		 345 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  57.79 
 
 		 339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4958  fimbrial protein  41.82 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524555  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  25.61 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  26.38 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  25.77 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  25.12 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  31.82 
 
 		 187 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  28.24 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  30.57 
 
 		 184 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  31.02 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  29.86 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  24.8 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  32.62 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  31.43 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  31.43 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  31.43 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  22.99 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  26.83 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  31.82 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  31.82 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  32.73 
 
 		 181 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.66 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.66 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  27.31 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  31.82 
 
 		 187 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.66 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  26.1 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  25.91 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.47 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.47 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.47 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.47 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.47 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.47 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  28.82 
 
 		 176 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  24.74 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  25.1 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  30.77 
 
 		 183 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  26.05 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  27.33 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  30.87 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  27.91 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  27.74 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  35.78 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  27.74 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.82 
 
 		 172 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  29.2 
 
 		 181 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>