31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6640 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6640  fimbrial protein  100 
 
 		 318 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447531  hitchhiker  0.00000000139123 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  49.67 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  35.06 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  32.27 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  28.62 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  28.76 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  29.18 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  28.67 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  28.67 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  26.8 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  31.62 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  31.62 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  31.09 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  31.3 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  31.03 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  31.29 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  29.3 
 
 		 175 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  26.75 
 
 		 175 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  26.67 
 
 		 179 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  27.61 
 
 		 182 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  25.58 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.39 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.39 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.39 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  24.18 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.32 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  28.16 
 
 		 169 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  28.16 
 
 		 181 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.32 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  28.16 
 
 		 181 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  30.32 
 
 		 323 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>