50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4408 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51470  fimbrial subunit CupC1  64.08 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00125924  hitchhiker  0.000154945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3290  fimbrial protein  63.13 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0324288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  32.08 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1131  fimbrial protein  32.04 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1312  fimbral biosynthesis protein  31.49 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467009  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  34.13 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.84 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3922  Fimbrial protein  30.43 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.422951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  37.39 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3809  Fimbrial protein  30.43 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00136767  normal  0.0813635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  33.68 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  33.68 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  33.68 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  33.68 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  32.96 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  30.77 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  33.49 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  33.33 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  30.77 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  33.16 
 
 		 172 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.98 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.81 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0830  Fimbrial protein  31.22 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  32.23 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3753  fimbrial protein-like protein  32.97 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  32.06 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2448  fimbrial protein  28.29 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  29.5 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  29.93 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0761  Fimbrial protein  29.9 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.977833  normal  0.0148789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26.07 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  25.59 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  32.88 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  27.5 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  27.15 
 
 		 351 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  30.82 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  31.1 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  29.86 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  30.41 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  35 
 
 		 370 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  31.9 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  31.9 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  31.9 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  28.18 
 
 		 181 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  28.18 
 
 		 181 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  31.9 
 
 		 175 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>