83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3290 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3290  fimbrial protein  100 
 
 		 197 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0324288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  60.7 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51470  fimbrial subunit CupC1  56.44 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00125924  hitchhiker  0.000154945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1131  fimbrial protein  37.19 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1312  fimbral biosynthesis protein  36.68 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  35.8 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  33.18 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  34.5 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  32 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  31.47 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  31.84 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  31.84 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  35.38 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  31.84 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  32.51 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  32.49 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.47 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  31.47 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.47 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.47 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  32.14 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  28.64 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  29.85 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  34.24 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  32.65 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  33.33 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  33.33 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  33.33 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3809  Fimbrial protein  31.73 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00136767  normal  0.0813635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3922  Fimbrial protein  31.73 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.422951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  34.68 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  34.68 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  31.31 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.96 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0830  Fimbrial protein  33.83 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.12 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.12 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3753  fimbrial protein-like protein  36.31 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.96 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.96 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.46 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  27.86 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  31.37 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0761  Fimbrial protein  31.71 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.977833  normal  0.0148789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  28.73 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  31.25 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  26.37 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  26.37 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  31.52 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  26.26 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25.71 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.71 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.71 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  30.87 
 
 		 359 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.71 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  32.43 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.71 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.71 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  30.81 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  25.71 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  28.02 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  28.05 
 
 		 351 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  32.69 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  32.86 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  31.71 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  30.28 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  30.48 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  30.28 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  33.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2448  fimbrial protein  27.27 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  33.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  30.64 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  30.64 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  33.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  33.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  30.81 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  37.84 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  29.41 
 
 		 336 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  30.48 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.87 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.87 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  24.5 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>