17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0152 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0152  fimbrial protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00100089  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3461  Fimbrial protein  92.27 
 
 		 194 aa  362  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000984412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0145  fimbrial protein  92.27 
 
 		 194 aa  362  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000164783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00140  predicted fimbrial-like adhesin protein  91.75 
 
 		 194 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0047782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00139  hypothetical protein  91.75 
 
 		 194 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00369206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0132  hypothetical protein  91.06 
 
 		 124 aa  226  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000008388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  42.78 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0150  fimbrial protein  40.1 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00359988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  38.67 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3976  pilin chaperone ecpD2  38.67 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  27.64 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  27.51 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  29.44 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  24.75 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  24.75 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  24.75 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  24.75 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>