15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0150 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0150  fimbrial protein  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00359988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  84.77 
 
 		 197 aa  334  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  42.36 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3976  pilin chaperone ecpD2  45.02 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0152  fimbrial protein  41 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00100089  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00140  predicted fimbrial-like adhesin protein  40 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0047782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00139  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00369206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3461  Fimbrial protein  39.5 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000984412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0145  fimbrial protein  39.5 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000164783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0132  hypothetical protein  36.97 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000008388  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0211  major fimbrial subunit  31.37 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  30.56 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  29.86 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.86 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1501  fimbrial protein  26.24 
 
 		 181 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>