20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2116 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  100 
 
 
96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  97.92 
 
 
167 aa  192  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  96.88 
 
 
167 aa  191  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  96.88 
 
 
167 aa  191  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  96.88 
 
 
167 aa  191  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  96.88 
 
 
167 aa  191  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  95.83 
 
 
167 aa  189  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  97.73 
 
 
215 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  56.84 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  56.84 
 
 
167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  56.84 
 
 
167 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  56.84 
 
 
167 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  56.84 
 
 
167 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  56.84 
 
 
167 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  56.84 
 
 
167 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  36.36 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  29.7 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  33.67 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  29.9 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  31.63 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>