81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04150 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  337  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  100 
 
 
167 aa  337  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  100 
 
 
167 aa  337  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  100 
 
 
167 aa  337  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  99.4 
 
 
167 aa  336  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  98.8 
 
 
167 aa  332  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  95.81 
 
 
167 aa  325  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  57.23 
 
 
167 aa  203  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  57.23 
 
 
167 aa  203  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  57.23 
 
 
167 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  57.23 
 
 
167 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  57.23 
 
 
167 aa  203  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  56.63 
 
 
167 aa  201  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  57.86 
 
 
215 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  56.84 
 
 
96 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  37.14 
 
 
183 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  33.53 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  33.11 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  33.54 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  31.76 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  30.91 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  30.38 
 
 
185 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  30.91 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  30.91 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  30.91 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  30 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  30 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  30 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  30 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  29.41 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  31.11 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.11 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  31.11 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.11 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  29.44 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  30.56 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  35.61 
 
 
184 aa  50.8  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  35.61 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  33.15 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  33.15 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  32.48 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  33.33 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  33.64 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  33.64 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  32.35 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  33.64 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  33.64 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  32.35 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  33.64 
 
 
181 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  28.32 
 
 
175 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  29.45 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  29.45 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  29.45 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  29.45 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.45 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  36.96 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  33.06 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  33.33 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.48 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.48 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  33.33 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.48 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  25.74 
 
 
315 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  33.33 
 
 
186 aa  44.3  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  36.96 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  36.96 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  36.96 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  36.96 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  36.96 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  36.96 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  36.96 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  32.19 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  32.19 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  32.19 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  32.19 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  27.95 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  32.19 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  36.17 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  31.3 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.17 
 
 
180 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  26.9 
 
 
170 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>