96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4950 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  99.46 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  97.84 
 
 		 185 aa  362  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  31.36 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  32.8 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  29.61 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  30.41 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  30.41 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  30.41 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  30.41 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  30.41 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  30.41 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  28.85 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  28.29 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  28.98 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.75 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  28.98 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  28.98 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.75 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.58 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  33.09 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.09 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  33.09 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  33.09 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  28.85 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  32.37 
 
 		 171 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  27.41 
 
 		 370 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  28.57 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  30.07 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  30.07 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  30.07 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  30.07 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  30.07 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  28.95 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  30.12 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.58 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.58 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.58 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  29.41 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  29.41 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  29.41 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  26.14 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.67 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  27.71 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.71 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  29.41 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  25.84 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  26.14 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  27.74 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  23.91 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  27.74 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  27.74 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.91 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  27.74 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  23.91 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  23.91 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  28.82 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  24.46 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  27.14 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  24.84 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  27.01 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  27.14 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  27.91 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  24.84 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  25 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  25 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  25 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  25 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  24.43 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  23.37 
 
 		 167 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  23.36 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  26.27 
 
 		 371 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  23.36 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  23.36 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  29.75 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  23.36 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  27.39 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  27.07 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  24.18 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  24.43 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  24.18 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  24.43 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  24.18 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  27.91 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  27.91 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  29.3 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  24.43 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  32.81 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  24.18 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.75 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  27.88 
 
 		 193 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  28.31 
 
 		 193 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.1 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>