15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00668 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  96.08 
 
 
188 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  96.08 
 
 
188 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  96.08 
 
 
188 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00668  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  92.16 
 
 
188 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  88 
 
 
188 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  41.86 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  43.48 
 
 
183 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  43.48 
 
 
183 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  43.48 
 
 
183 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  43.48 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  43.48 
 
 
183 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  43.48 
 
 
183 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  43.24 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>