15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_11110  fimbrial protein cupB6  100 
 
 		 381 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1019  fimbrial protein CupB6  69.74 
 
 		 379 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1537  fimbrial protein  38.48 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  32.28 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  31.65 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  33.33 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  30.87 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  25.9 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  25.9 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  25.9 
 
 		 175 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  25.9 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  21.48 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  21.48 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  21.48 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3982  protein LpfE  25.9 
 
 		 174 aa  42.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>